基于超声波激发的海马溶酶体蛋白质组选择性原位标记及关键调控蛋白发现，所创新（DICP I202316），项目负责人：江波，2024-2025年

面向合成生物学细胞器工程的线粒体蛋白质组绝对定量分析方法，创新研究青年基金（DICP I202427），项目负责人：刘健慧，2024-2025年

基于原位化学交联技术的Tau蛋白寡聚体扩散受体发现及功能研究，所探索基金（DICP I202413），项目负责人：赵宝锋，2024-2025年

基于芯片存储与深度学习的蛋白质高通量空间离位成像，所创新（DICP I202207），项目负责人，张晓哲，2023-2024年

基于肿瘤类器官和细胞表面蛋白组学的肺癌免疫治疗疗效预测新分子标志物研究，医工合作（DMU-2&DICP UN202405） 项目负责人：江波，2024-2026

基于肝细胞癌发生谱系结节的多维度蛋白质组学研究，医工融合（DMU -2&DICP UN202301），项目负责人：梁振，2023-2025年

基于外泌体蛋白质组分析的甲状腺乳头状癌无创判别，医工融合（DMU-2&DICP UN202310），项目负责人：梁玉，2023-2025年

临床级脐带间充质肝细胞来源细胞囊泡标准化技术评价体系的建立，医工融合（DMU-1&DICP UN202204），项目负责人：赵宝锋，2023-2024年